Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sem1P60897 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sem1P60897 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms