Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Paxbp1P58501 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Paxbp1P58501 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms