Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smpdl3bP58242 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smpdl3bP58242 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms