Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Bace1P56818 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Bace1P56818 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms