Protein–RNA interactions for Protein: P56656

Cyp2c39, Cytochrome P450 2C39, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c39P56656 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cyp2c39P56656 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cyp2c39P56656 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms