Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd38P56528 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms