Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cox7bP56393 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms