Protein–RNA interactions for Protein: P55271

Cdkn2b, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2bP55271 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cdkn2bP55271 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2bP55271 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cdkn2bP55271 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms