Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cacnb3P54285 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cacnb3P54285 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms