Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
CnbpP53996 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms