Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PctpP53808 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PctpP53808 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PctpP53808 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PctpP53808 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PctpP53808 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PctpP53808 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PctpP53808 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms