Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fdft1P53798 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fdft1P53798 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms