Protein–RNA interactions for Protein: P52624

Upp1, Uridine phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp1P52624 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Upp1P52624 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms