Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube2e3P52483 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms