Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp10P52479 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp10P52479 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms