Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Polr1cP52432 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1cP52432 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms