Protein–RNA interactions for Protein: P51859

Hdgf, Hepatoma-derived growth factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdgfP51859 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HdgfP51859 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HdgfP51859 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms