Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RoraP51448 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RoraP51448 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms