Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Defa-rs12P50716 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa-rs12P50716 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms