Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FmodP50608 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FmodP50608 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FmodP50608 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FmodP50608 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
FmodP50608 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.8 ms