Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SftpdP50404 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SftpdP50404 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms