Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmod1P49813 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmod1P49813 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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