Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtpreP49446 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms