Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx3P48759 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx3P48759 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms