Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Epb41P48193 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Epb41P48193 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms