Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl13P47963 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl13P47963 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms