Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl5P47962 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms