Protein–RNA interactions for Protein: P47801

Emp1, Epithelial membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp1P47801 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Emp1P47801 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Emp1P47801 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms