Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SrprbP47758 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrprbP47758 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms