Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tulp2P46686 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms