Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tnfsf4P43488 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf4P43488 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms