Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tac1P41539 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tac1P41539 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms