Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timp3P39876 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Timp3P39876 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms