Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TtlP38585 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TtlP38585 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TtlP38585 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms