Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lig1P37913 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms