Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PtprkP35822 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PtprkP35822 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PtprkP35822 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PtprkP35822 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms