Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5cP35278 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rab5cP35278 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5cP35278 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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