Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prim2P33610 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms