Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola1P33609 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola1P33609 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms