Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cdh15P33146 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cdh15P33146 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms