Protein–RNA interactions for Protein: P31695

Notch4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch4P31695 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch4P31695 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms