Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tacr1P30548 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms