Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pabpc1P29341 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms