Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apex1P28352 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apex1P28352 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms