Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Etv4P28322 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Etv4P28322 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Etv4P28322 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Etv4P28322 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Etv4P28322 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms