Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb3P28231 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gjb3P28231 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms