Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gjb1P28230 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gjb1P28230 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms