Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2afxP27661 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2afxP27661 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
H2afxP27661 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms