Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CftrP26361 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CftrP26361 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CftrP26361 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CftrP26361 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CftrP26361 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CftrP26361 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CftrP26361 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CftrP26361 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CftrP26361 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CftrP26361 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CftrP26361 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms