Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm37317-201ENSMUST00000192198 1024 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Olfr1247-201ENSMUST00000099771 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm15754-201ENSMUST00000119191 478 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxd11P23813 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd11P23813 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Ighv10-2-201ENSMUST00000195182 298 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd11P23813 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd11P23813 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd11P23813 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Hoxd11P23813 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm37932-201ENSMUST00000192258 1167 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Vmn1r89-205ENSMUST00000227276 1417 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxd11P23813 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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